中國科學院深圳先進技術研究院（以下簡稱先進院）成立于2006年２月。先進院的使命和愿景是提升粵港地區及我國先進制造業和現代服務業的自主創新能力，推動我國自主知識產權新工業的建立，成為*的工業研究院。

先進技術院由先進集成技術研究所、生物醫學與健康工程研究所、先進計算與數字工程研究所、開放技術平臺、工程中心、行政管理部門等部分組成。

中國科學院香港中文大學深圳先進集成技術研究所由中國科學院、深圳市人民政府和香港中文大學協商共建，致力于現代裝備制造業及服務業的基礎性、前瞻性、戰略性的研究。生物醫學與健康工程研究所致力于低成本、集成化、網絡化、智能化的創新醫療設備的研究；先進計算與數字工程研究所致力于數字城市、數字生態、數字工程等應用領域的高性能計算技術、網格技術、智能技術與仿真模擬技術研究；開放技術平臺由一系列基于儀器設備支撐的實驗室組成，為先進技術院科技活動提供測試、調試、加工等技術支撐與服務，并向企業和其它科研單位開放。工程中心開展技術轉移、成果轉化與企業孵化等相關工作。此外，先進院在繼續完善原有各個技術平臺及實驗室的同時，通過爭取社會各方面資源，集中力量建設高密度集成電路封裝技術國家工程實驗室、中國科學院超級計算中心華南分中心、中國科學院生物醫學信息與健康工程學重點實驗室等3個重點實驗室；目前正在建的包括深圳市射頻集成電路重點實驗室、深圳市低成本健康重點實驗室、深圳市汽車環保節能技術重點實驗室等涵蓋了光、機、電、計算、材料、生化等多個技術領域。

截至2008年底，先進院在職職工有313人，其中中國工程院院士1名，中科技人員146名，具有博士學位138名；香港中文大學共派入17位教授，聘任AF教授11位；訪問教授/客座教授8位；有17位分別入選“新世紀百千萬人才工程”*人選、中科院“百人計劃”、深圳市“雙百計劃”和先進院“百人計劃”。“高精度多模態生物醫學影像”創新團隊合作伙伴計劃正式啟動；有研究生導師43人，其中博導24人；在站博士后21人；共培養研究生493人（含客座學生），在讀研究生237人。

2008年，先進院共申報各類項目逾254項，共獲批70項，其中，國家項目15項（重大專項２項，“863”項目3項，國家自然科學基金項目10項）。“高密度三維系統級封裝關鍵技術”研究獲國家科技02重大專項支持，“用于昆蟲/小動物微觀結構及仿生學研究的顯微CT研發”和“銅銦鎵硒薄膜太陽能電池共蒸發生長系統”兩個項目獲得中科院重大裝備項目支持。由先進院牽頭組織，多家研究所參與的“電動車整車及關鍵技術開發重大項目”獲中科院支持。虛擬人、虛擬手術、遠程訓練等項目獲得國家自然科學基金支持。重大裝備項目“用于昆蟲/小動物微觀結構及仿生學研究的顯微CT研發”完成可行性論證，開始組團攻關。爬壁機器人、微創手術機器人已進入現場測試和產業化階段。中科院超級計算中心深圳分中心獲批。先進院牽頭組織實施中科院電動車項目，在高交會推出雙座純電動車的基礎上開始新車的研制工作。先進院獲批中科院重大裝備研制項目 –銅銦鎵硒薄膜太陽能電池共蒸發生長系統。“混合動力碼頭車及其關鍵技術” 獲深港創新圈重點項目支助，已完成*代實驗樣機開發。先進院與美的集團制冷合作部合作的冷凍機油項目已通過初始配方的臺架實驗，有望打破日本在該領域的壟斷，*代儲能材料完成并用于“節能建材”領域，成功切入中移動 “戶外機房”市場。

2008年，先進院共發表論文近300篇，是2007年發表論文數的2倍，其中SCI、EI論文近196篇；，申請129項（其中發明占70%），受理97項，授權7項，獲深圳市南山區知識產權先進單位的榮譽稱號。

2008年，先進院在深圳共舉辦11次大型國內外學術會議，包括主辦、承辦第五屆生物醫學信息技術與應用會議暨第二屆生物醫學與健康工程研討會、第五屆可穿戴植入式軀體傳感網絡研討會、高交會院士論壇、第七屆網格與協同計算會議、先進集成技術論壇、中國科學院-印度科學院信息與通信技術研討會、“數字建模與可視化研討會”等；設立了“青年交流基金”，選派人才到海外學習交流，引進3名海外人員來院留學，逐步開拓“引進來”和“走出去”的合作新局面。

2008年，先進院與企業簽署工業合同40個，共建4個工業實驗室。轉化過程中的達30件，占總比例30%以上。無形資產新參股公司４家（共11家）。組織92項成果參展第十屆高交會，獲32個獎項，占當年高交會全部獎的1/7強。工程中心獲批成為國家技術轉移示范機構。強華公司MH-100多功能健康檢查床產品正式下線，取得市場準入證書，預計明年訂單將突破400臺。面對金融風暴，先進院自發開展產業創新行動計劃，承諾自2009年起將綜合技術平臺全部儀器設備免費提供給企業使用一年。被列為深圳市CAE公共技術服務平臺的“產品仿真與工程實驗室”在深圳市2008年度公共技術服務平臺的評選中一舉奪冠。